一般羊膜穿刺带来的严重不适，或异常情况非常罕见，但一旦出现阴道出血或者流水，抑或是其他疼痛，则需要及时去就医咨询。
但同其他检查一样，羊膜穿刺检查也无法保证100%的检测成功率，即相关基因异常有一定几率无法通过羊膜穿刺检查被发现。